Atlas Üniversitesi'nin logosunda kelebek olmasının nedeni, üniversitenin "kelebek etkisi" sloganını benimsemesidir 12.

"Kelebek etkisi", bir durumun başlangıç verilerindeki küçük değişikliklerin büyük ve beklenmedik sonuçlar doğurabilmesine verilen addır 12.

Atlas Üniversitesi, logosunda yukarıyı ve ileriyi işaret eden bir pusula iğnesi, okyanus, harita, geçmişten geleceğe yolculuk ve sonsuza uzanan ufuklar gibi fikirlerden ilham alarak tasarlanmıştır 2. Logodaki yıldız, denizcilik haritalarında kullanılan kuzey yıldızıdır 2.

Üniversitenin kuruluş sayfasında yer alan bir gönderiye göre, Atlas Üniversitesi'nin kuruluş yıl dönümüne ithafen yapılan açıklamada, "Her bir öğrencimiz, hem kendisi hem de tüm insanlık adına büyük keşifler ve katkılar yapmanın potansiyelini içinde taşır 3. Pek çok büyük buluş, özveriyle gerçekleştirilmiş küçük bir adımın gelecekteki sonucudur 3. Bu yüzden üniversitemizi kurarken, gelecekte bir gün bu küçük adımın büyük sonuçları olacağını umut ederek ‘kelebek etkisi’ sloganını benimsedik ve ona ‘Atlas’ adını verdik 3." ifadeleri yer almaktadır.