Akşemsettin'in Fatih Sultan Mehmet'e kızmasının nedeni, Fatih'in dervişliğe kabul edilme isteği olabilir 1. Akşemsettin, dervişliğin dünya işlerinden el çekmeyi gerektirdiğini ve Fatih'in böyle yapmasının ülkenin zararına olacağını belirtmiştir 1.

Ayrıca, Akşemsettin'in Fatih'e yazdığı mektupta, fethe inananlarla inanmayanların ayrılması gerektiği yönünde bir öğüt verdiği iddiası da bulunmaktadır 2. Ancak, mektubun orijinalinde böyle bir ifade geçmemektedir 2.

Akşemsettin'in, Fatih'in bir ziyaretinde huzura girişinde ayağa kalkmaması da bir başka olay olarak kaydedilmiştir 3. Akşemsettin, bu hareketi, Fatih'in gururunu terbiye etmek amacıyla yaptığını açıklamıştır 3.

Bu olaylar dışında, Akşemsettin ve Fatih arasında geçen başka bir anlaşmazlık, Akşemsettin'in yeniçerilerin başına devşirme olmayan, Müslüman doğmuş birinin geçirilmesi gerektiği görüşü ve devşirmeleri eleştirmesiyle ilgili olabilir 5.