Allotrofi ve izomerizm farklı kavramlardır: Allotrofi, aynı elementin farklı fiziksel formlarını ifade eder. İzomerizm, aynı kimyasal formüle sahip ancak atomların farklı düzenlemelerini sergileyen moleküllerin varlığını içerir. Yapısal izomerler, atomların bağlantıları açısından farklılık gösterir. Stereoizomerler, aynı kimyasal formüle ve kurucu atomları arasında aynı bağlantıya sahip olup, atomların uzaysal düzenlemelerinde farklılık gösterir.