Enstitülerde bulunan bölümler, enstitünün türüne ve amacına göre değişiklik gösterebilir. Genel olarak enstitülerde aşağıdaki bölümler bulunmaktadır: Sosyal Bilimler Enstitüsü: Sosyoloji, psikoloji, tarih, siyaset bilimi, hukuk, iletişim, edebiyat gibi disiplinleri içerir. Eğitim Bilimleri Enstitüsü: Eğitim yönetimi, ölçme ve değerlendirme, öğretim teknolojileri, rehberlik ve psikolojik danışmanlık gibi ana bilim dallarını kapsar. Fen Bilimleri Enstitüsü: Fizik, biyoloji, matematik, kimya, mühendislik, siber güvenlik, yazılım bilişim ve iş güvenliği alanlarında eğitim verir. Ayrıca, enstitüler bağımsız olarak da kurulabilir ve belirli bir alanda mesleki eğitim ve araştırma yapabilirler.