Docking@Home

Docking, iki molekülün, genellikle bir ilaç adayı olan küçük bir molekül ile bir hedef protein gibi büyük bir molekülün, nasıl ve nerede etkileşime girdiğini tahmin etmek için kullanılan bir bilgisayar simülasyonudur.

Bu etkileşimler, ilaç geliştirme sürecinde çok önemli rol oynar çünkü etkili bir ilacın, hedef proteine sıkı bir şekilde bağlanması gerekir.

Docking, temel olarak iki aşamada çalışır:

1. Arama aşaması: Küçük molekülün, büyük molekülün yüzeyindeki olası bağlanma bölgeleri aranır. Bu, bir anahtarın kilide uymasına benzetilebilir.
2. Bilgisayar programı, küçük molekülün büyük molekülün hangi kısmına en iyi uyacağını hesaplar. Bu, bağlanma enerjisi denilen bir değerle ifade edilir. Düşük bağlanma enerjisi, daha güçlü bir bağlanmayı gösterir.