Mogadişu'da Eylül genellikle sıcak geçer. Eylülnın gündüz ortalama sıcaklığı sıfırın üstünde 27 derece. Eylül Mogadişu'da ortalama güneşli gün: 17, parçalı bulutlu gün sayısı: 8. Yağışlar genellikle hafif geçer. Eylülve ayrıca Ocak, Şubat, Mart Mogadişu ziyaret için en uygundur.