İzmir Körfezi'nin kirli olmasının başlıca nedenleri şunlardır: 1. Atık Su Deşarjları: Körfezin etrafında yaklaşık 5 milyon insanın yaşaması ve arıtma kapasitesinin şehrin yükünü kaldıramaması, atık su deşarjlarının artmasına yol açmıştır. 2. Mikroplastik Kirliliği: Özellikle naylon poşetlerin parçalanmasıyla oluşan mikroplastikler, körfezdeki kirliliğin önemli bir kısmını oluşturmaktadır. 3. Küresel Isınma ve Sıcaklık Artışı: Küresel ısınma nedeniyle ortalama sıcaklıkların artması, mikroalglerin üremesini tetiklemiş ve sudaki kirlenmeyi artırmıştır. 4. Çiğli Atık Su Arıtma Tesisi: Bu tesisin verimli işletilememesi, körfeze arıtılmadan büyük miktarda katı atık dökülmesine neden olmaktadır. Bu sorunlar, körfezdeki oksijen seviyesini düşürerek balık ölümlerine ve kötü kokuya yol açmaktadır.