Babalar Günü'nün kökeni, 20. yüzyılın başlarına dayanır ve Amerika Birleşik Devletleri'nde ortaya çıkmıştır .
Hikayenin temelinde, Sonora Smart Dodd'un babası William Jackson Smart'ı onurlandırmak isteği yatar . Dodd, annesinin yokluğunda altı kardeşine bakan babasına olan sevgisini ve minnettarlığını göstermek için, babasının doğum günü olan 5 Haziran'ın Babalar Günü olarak kutlanmasını önermiştir .
Ancak, organizasyon hazırlıkları yetişmediği için kutlama tarihi, Haziran ayının üçüncü pazar gününe ertelenmiştir . İlk kutlama, 19 Haziran 1910'da Washington'un Spokane şehrinde gerçekleştirilmiştir .
Babalar Günü, 1924'te Başkan Calvin Coolidge'in desteğiyle resmi bir statü kazanmış, ancak resmi olarak ilan edilmemiştir . 1966'da Başkan Lyndon B. Johnson, Babalar Günü'nü ulusal düzeyde kutlanan bir gün olarak ilan etmiş, 1972'de ise Başkan Richard Nixon, Babalar Günü'nü resmi bir ulusal tatil olarak kabul eden yasayı imzalamıştır .